Οι χώροι της Κλινικής εκτείνονται σε 3 ορόφους. Συγκεκριμένα, η κυρίως μονάδα νοσηλείας με 28 κλίνες, βρίσκεται στον 2ο όροφο του Γ’ κτιρίου του Νοσοκομείου. Η Νοσηλευτική Μονάδα διαθέτει ξεχωριστό χώρο καθημερινής Κλινικής πράξης (εξεταστήριο) για τους Ιατρούς με δικό της μηχάνημα Υπερήχων σε τροχήλατη βάση. Στον ίδιο όροφο και σε επαφή με την Κλινική βρίσκονται τα γραφεία των Ειδικών του Τμήματος, καθώς επίσης ο χώρος των ενδοκλινικών μαθημάτων - γραμματέως Κλινικής, η αίθουσα Σεμιναρίων όπου λαμβάνουν χώρα τα Ουρολογικά Συμπόσια Κεντρικής Ελλάδας, χώρος ενδιαίτησης προσωπικού, χώρος αρχείου Κλινικής και το δωμάτιο των εφημερευόντων Ιατρών.

Στον 1ο όροφο (χώρος Τακτικών Ιατρείων Νοσοκομείου) βρίσκονται οι χώροι των 2 εξωτερικών Ιατρείων που αποτελούνται από 2 δωμάτια και ένα ξεχωριστό WC ο καθένας. Στο χώρο του πρώτου ιατρείου υπάρχει μόνιμο μηχάνημα υπερήχων με διακοιλιακή και διορθική κεφαλή, ενώ στο έτερο ιατρείο υπάρχει το εξεταστικό κρεβάτι (bum) όπου διενεργούνται κυστεοσκοπήσεις και άλλες κυστεοσκοπικές - διουρηθρικές πράξεις. Στον ίδιο όροφο βρίσκεται και το Ανδρολογικό Ιατρείο που επίσης διαθέτει συσκευή υπερήχων.

Στο ισόγειο του Νοσοκομείου βρίσκεται ο χώρος του Εξωσωματικού Λιθοτρίπτη μαζί με δωμάτιο χειριστών, γραμματείας, βραχείας νοσηλείας τριών κλινών, 2 ξεχωριστά εξεταστήρια - ιατρεία, χώρο κυστεοσκοπήσεων και καθετηριασμών ανώτερου ουροποιητικού και χώρους αποθήκης και WC για ιατρούς και ασθενείς. Στον χώρο του Τμήματος Λιθοτριψίας φιλοξενείται το Ιατρείο Ουροδυναμικού ελέγχου με ξεχωριστό γραφείο και δωμάτιο εξεταστηρίου. Ο χώρος αυτός διαθέτει δύο συσκευές υπερήχων (η μια φορητή) με τροχήλατη βάση οι οποίες βρίσκονται σε καθημερινή χρήση από τα ιατρεία και το Τμήμα Λιθοτριψίας.